哥白尼大学（NCU）根据1945年8月24日的部长理事会的法令创建。影响并决定大学建立在托伦在很大程度上是因为需要弥补战时波兰科学与文化的损失，和弥补维尔纽斯Stefan Batory大学（现维尔纽斯，立陶宛）和利沃夫Jan Kazimierz大学（现利沃夫，乌克兰）的损失。二战之后，这些城市发现自己在波兰境外，因此一部分重要的哥白尼大学的员工第一时间从这些大学搬迁回来。
最初，这个新成立的大学有四个学院和近60名教授，其中有一些知名学者：Tadeusz Czeżowski 和 Henryk Elzenberg（哲学家），Karol Górski（历史学家），Stefan Srebrny（语言学家），Władysław Dziewulski 和 Wilhelmina Iwanowska（天文学家），Alexander Jabłoński（物理学家） 和 Tymon Niesiołowski, Jerzy Hoppen, Bronisław Jamontt 和 Stanisław Borysowski（艺术家和教师）。
